Equipe I : Cardiopathies et mort subiteThème Ia : Génétique clinique et moléculaireEquipe Avenir ATIP -Variations génétiques et mort subite cardiaque - Situation/Catégorie : Chargé de Recherche
Thème de RechercheAprès l'obtention de mon doctorat à l'Université de Strasbourg en 2002, j'ai rejoint le Sanger Institute (Cambridge, GB) pour identifier par la technologie des puces à ADN des petites délétions ou duplications chromosomiques (appelées CNV) responsables de retard mental chez l'enfant. Mes travaux ont montré que 10 à 15% des cas de retard mental syndromique sont causés par la présence spécifique d'un CNV chez l'enfant, mais que d'autres CNV sont également retrouvés chez ses parents non atteints. Suite à ces résultats, j'ai pris en charge le criblage à grande échelle de CNV dans les génomes de 270 individus de la population générale. Les résultats, publiés dans le revue
/Nature/ en novembre 2006, montrent que ce nouveau type de polymorphisme est bien plus répandu qu'on ne le pensait précédemment. Ils bouleversent notre vision du génome humain et suggèrent un lien étroit entre CNV et phénotypes. Je rejoins aujourd'hui l'institut du thorax pour appliquer les nouvelles technologies d'analyse du génome à l'identification de facteurs génétiques associés au risque de mort subite cardiaque chez l'adulte.
Contrats de Recherche:Variations génétiques et mort subite cardiaque
Inserm Avenir/ATIP - Région Pays de la Loire
Porteur du projet
2010 - 2013
Le but de ce projet de recherche est d'identifier de nouveaux gènes responsables de maladies associées à un rythme cardiaque anormal et qui confèrent un risque très élevé de mort subite cardiaque. Une de ces maladies, appelée le syndrome de Brugada, a été associée à des mutations ponctuelles d'un gène, nommé SCN5A, qui est important pour le bon fonctionnement des cellules cardiaques. Cependant, seulement 20 à 30% des patients atteints du syndrome de Brugada sont porteurs de mutations de SCN5A : d'autres gènes responsables de ce syndrome restent encore à découvrir. L'objectif est d'identifier ces autres gènes dont les mutations sont associées à un risque accru de mort subite cardiaque.
Les échantillons d'ADN provenant de 100 patients atteints de syndrome de Brugada et sans mutation de SCN5A seront analysés par une technique (appelée array-CGH) qui permet de détecter de manière systématique des pertes ou des gains chromosomiques de petite taille qui peuvent toucher un ou plusieurs gènes et causer le syndrome. Parallèlement, pour un sous-groupe de 10 patients, la quasi-totalité des gènes seront séquencés à haut-débit par l'utilisation d'une toute nouvelle technologie appelée séquençage massif par capture.
Chaque gène, pour lequel une altération aura été identifiée chez un patient par ces techniques, fera ensuite l'objet d'une analyse approfondie par séquençage systématique dans une cohorte de plus de 200 patients. Ce projet conduira à l'identification de nouveaux gènes responsables de la mort subite cardiaque chez l'adulte ; ceci permettra d'améliorer non seulement le diagnostic, mais également la prévention de cette pathologie dans la population générale. Au cours de ce projet de recherche, de nouvelles techniques de pointe seront mises en place à Nantes; elles permettront d'améliorer non seulement l'efficacité de la recherche mais également la qualité du diagnostic en génétique médicale.
